软腐病为细菌性病害，一般在芥菜生长后期才开始发病；发病初，植株外叶萎蔫，早晚还可恢复。
发病严重的病株叶柄基部及根茎髓部完全腐烂，充满浅灰褐色、粘稠状物质，且具有恶臭气味，*后茎基部烂成一个大空洞，严重时可造成全株死亡。
芥菜软腐病的发病原因：
软腐病 发病条件该病为细菌性病害，由细菌侵染致病。病菌在病株残体，堆肥中越冬。翌年通过雨水、灌溉水、肥料传播。病菌主要通过机械伤口、昆虫咬伤等侵入。在植株其它病害严重，生长衰弱，愈伤能力弱时发生严重。
在15-20℃的低温条件下，多雨、高温、光照不良等气候因素下，病害易流行。
生产上久旱遇雨，或蹲苗过度，浇水过量都会造成伤口而发病。地表积水，土壤中缺少氢气，不利根系发育或伤口木栓化则发病重。此外，还与品种、茬口、播期有关，一般连作地或低洼地及播种早的发病重。
芥菜软腐病的防治方法：
1、品种凡抗霜霉病、病毒病的品种，均抗软腐病。可参照病毒病一文。
2、轮作可与禾本科作物、豆类作物等不易感病的作物轮作，忌与十字花科、茄科、瓜类作物连作。
3、整地施肥选用高燥地块，忌低洼、潮湿、粘重地。应用高垄、高畦栽培，忌平畦。增施腐熟的有机肥，防止肥料带菌。
4、田间管理适当晚播，避开高温多雨易发病季节。雨季及时排水、防涝，降低田间湿度。发现病株，及时清除，携出田外，深埋或烧毁。病穴应撒石灰粉消毒。田间管理应尽量减少机械损伤。
5、及时防治病虫害及时防治地下害虫及其它食叶害虫，减少伤口。