1、用地窖保存。鲜百合放地窖里保存，由于地窖空气稀少、温度低，至少可以保存三个月以上。地窖里面的空气稀少，减少了鲜百合的有氧呼吸以及消耗的能量。另外地窖里面的温度较室外要低很多，进一步降低了植物的有氧呼吸作用，两者加起来足以使鲜百合保存很长的时间。
2、用泥土保存。用塑料袋将百合装好，把塑料里面的空气尽量除尽，然后放进一个坚实的塑料盒子里面。泥土保存其实和地窖保存的道理是相同的，但更加广泛实用一些，适合没有地窖的人。但效果较差，适合保存近一个月。
3、用水果保鲜剂保存。百合商贩常用水果保鲜剂保存百合，选用对青霉有抑制效果的保鲜剂对百合进行保存。用果蔬专用液体保鲜剂浸泡百合10分钟左右，然后捞出，晾干即可。
4、用河水保存百合。若有条件，可以利用河水或池塘来保存，保存期与水温相关，较短，约为2周到6周。
5、用冰块、干冰保存。在运输过程中要保存百合的话，最好的方法当然是用冰块或者干冰来保存，冰块能保持温度在0℃左右，而干冰则可以保持温度在-50℃以下，原理与冰箱类似，温度越低保存的效果越好。